1樓:匿名使用者
這些平臺中,只有ion torrent 是最新的半導體測序技術,2年來發展速度很快。因此如果要客觀評價的話,需要檢視更新的平臺比較的文章。推薦以下兩篇文章:
a tale of three next generation sequencing platform: ***parison of ion torrent, pacific bioscience and illuminar miseq sequencers
***parsion of next-generation sequencing systems
另外有訊息說,pgm的讀長已經達到400bp了,因此在通量上也應該會有相應的增加。
這是一個高通量測序的戰國時代。誰能笑到最後,大家拭目以待!
2樓:匿名使用者
看一下這篇文章,這裡面有著三種平臺的比較:
performance ***parison of benchtophigh-throughput sequencing platforms
裡面有通量、準確性、資料量、讀長等的比較。
什麼是普通的基因測序,它和高通量測序有什麼區別嗎
3樓:邂逅
「普通的基因測序」應該
是指「常規dna測序」吧,是用sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。
高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。
ngs的特點主要有:
1、通量高。一個run能產生500mb-600gb的資料量。
2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。
3、單位資料的成本非常低。現在很多專案測序的費用。已經非常低。生物資訊分析成本變得更為重要了。
dna 的 1代測序,2代測序,3代測序的區別是什麼啊?
4樓:垠元
第一代測序:指雙脫氧末端終止法,擴增後通過毛細管電泳讀取序列,每次獲取資料量少。
第二代測序:為高通量測序,採用微珠或高密度晶片邊合成邊測序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次獲得數g資料,相對與第三代,都仍然需要擴增的方法放大訊號,擴增後再檢測。
第三代測序:特點是單分子測序,多基於奈米科技,無需擴增,對單分鏈dna/rna直接用合成、降解、通過奈米孔等方式直接測序,核心特點是無需擴增所以成本更低。
5樓:匿名使用者
你說的1代2代指的是子代1代,2代嗎?原本的雙鏈dna就是親代,以親本為模板複製產生的子代dna就是子1代,子2代.....
高通量測序技術ngs用什麼儀器
6樓:換了好幾個人
「普通的基因測序」應該是指「常規dna測序」吧,是用sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。
高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。
不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。
ngs的特點主要有:
1、通量高。一個run能產生500mb-600gb的資料量。
2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。
3、單位資料的成本非常低。現在很多專案測序的費用。已經非常低。生物資訊分析成本變得更為重要了。
高通量測序(ycb)是什麼?和常規有什麼區別
7樓:匿名使用者
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能,高通量測序技術(high-throughput sequencing)又稱「下一代」測序技術("next-generation" sequencing technology),以能一次並行對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌,在生物資訊學中常用。
高通量測序分的原理是什麼?
8樓:天涯海角七樓號
對dna分子進行
序列測定。
1.對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌。
2.根據發展歷史、影響力、測序原理和技術不同等,主要有以下幾種:大規模平行簽名測序(massively parallel signature sequencing, mpss)、聚合酶克隆(polony sequencing)、454焦磷酸測序(454 pyrosequencing)、illumina (solexa) sequencing、abi solid sequencing、離子半導體測序(ion semiconductor sequencing)、dna 奈米球測序 (dna nanoball sequencing)等。
3.高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。
參考資料
誰能介紹下國內比較好的高通量測序公司?
9樓:東神
我們學院的高通量測序找的一家南京本地公司,叫諾唯贊生物,不知道你聽過沒。
我們一開始樣本量比較小,有的公司不接,最後找到他們公司,服務很好。
測序結果也很快,資料分析也比較靠譜,後來我們就基本都在他們家做了。
10樓:匿名使用者
國內還真沒有很多,我知道的有華大,諾禾和百邁客。做的都還不錯。親可以關注下。
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