1樓:匿名使用者
用去垢劑之類的崩解膜,之後變形蛋白質,測定一級結構,在分析氨基酸成分等(親水性)推出跨膜部分。
生物學上的跨膜結構域指的是什麼?怎樣**
2樓:demon陌
是跨膜蛋白的效應區域所展現。
**:依靠一個跨膜蛋白資料庫,包含了每個序列的一些附加資訊:如跨膜結構區域的數量、跨膜結構域的位置及其側翼序列的情況。
蛋白質序列中跨越細胞膜的區域,通常為α-螺旋結構,約20~25個氨基酸殘基。構成他的蛋白質的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。
3樓:匿名使用者
跨膜結構域(tran**embrane domain,tm),常常是由跨膜蛋
白的效應區域所展現.跨膜蛋白,通俗說即跨越膜的兩端的蛋白質,其跨膜部分為β桶或α螺旋結構.有一種專門**跨膜區的方法:
tmpred .它依靠一個跨膜蛋白資料庫,其包含了每個序列的一些附加資訊:如跨膜結構區域的數量、跨膜結構域的位置及其側翼序列的情況.
tmpred利用這些資訊並與若干加權矩陣結合來進行**.
4樓:cofe_飛
tmhmm:網頁連結
tmhmm(中文版):網頁連結
tmpred:網頁連結
tmap這個好像訪問不了,就不貼**了。
怎樣分析**蛋白質的跨莫結構跨膜結構
5樓:匿名使用者
進入expasy的**:http://expasy.
***/tools/protscale.html,選擇hphob. / kyte & doolittle 。
將氨基酸序列輸入,得到一個圖表,其中數值越大的部分表示這段氨基酸序列的疏水性越強,越有可能是跨膜區域,再與已知的同源蛋白質比較(ncbi中的blast),即可大致**跨膜結構。所採用的氨基酸親水性演算法請參見文獻:a ****** method for displaying the hydropathic character of a protein。
6樓:匿名使用者
建議你看看生物資訊學,網上有些免費資料庫**可以**你提交的蛋白質氨基酸序列的跨膜結構。
生物學上的跨膜結構域指的是什麼?怎樣**?
7樓:匿名使用者
跨膜結構域(tran**embrane domain,tm),常常是由跨膜蛋白的效應區域所展現。 跨膜蛋白,通俗說即跨越膜的兩端的蛋白質,其跨膜部分為β桶或α螺旋結構。 有一種專門**跨膜區的方法:
tmpred .它依靠一個跨膜蛋白資料庫,其包含了每個序列的一些附加資訊:如跨膜結構區域的數量、跨膜結構域的位置及其側翼序列的情況。
tmpred利用這些資訊並與若干加權矩陣結合來進行**。
8樓:匿名使用者
指細胞膜上的物質運輸吧...
為什麼要對蛋白進行跨膜結構域**?跨膜結構域越多是不是越難分離
9樓:***
跨膜結構域**一半是為了分析蛋白質的定位。如果有,就可能是膜蛋白,這對分析其功能、制定純化方案以及表達方式都很有幫助。如果確定是膜蛋白,功能就可能是受體、通道之類的,純化就按疏水蛋白來設計,表達就要考慮真核表達系統。
10樓:
跨膜蛋白有一個比較普遍的特性,他的跨膜結構域一般是疏水的,而膜外的結構一般是親水的。是不是可以用專一性較大的蛋白酶進行處理。把得到的多肽片段,用疏水色譜法處理。
疏水色譜法:在高鹽濃度下,蛋白質的疏水性增加,可與疏水性介質結合;然後使鹽度逐漸下降,不通的多肽因疏水性不同依次被洗脫下來。完全自己的想法,不知道可不可以。
11樓:殷珧淦高峰
紅色柱子就是表示可能是跨膜區域的可信度,所謂的陽性閾值,看你怎麼取怎麼用了,說白了,一般概率大於0.5,也就是說跨膜區域的可能性大於一半咯,但是0.5附近就等於什麼都沒說了,可能性各一半,所以**結果就是。。
12樓:再不會有我
首先要確定兩個蛋白質之間有相互作用 再去尋找結構域,可以用的方法有 研究文獻,如果有晶體衍射做出的相互作用結構域的報道,那麼一定要仔細研究 要研究清楚目的蛋白的**結構,比如螺旋、片層的蛋白起始和結束位點確定研究方法,常用的有酵母。
蛋白跨膜結構**後怎麼分析
13樓:ada王一霏
首先要確bai定兩個蛋du白質之間有相互作用zhi 再去尋找結構域,dao可以用的方法有版 研究文獻,權如果有晶體衍射做出的相互作用結構域的報道,那麼一定要仔細研究 要研究清楚目的蛋白的**結構,比如螺旋、片層的蛋白起始和結束位點確定研究方法,常用的有酵母。
14樓:cofe_飛
不知道樓主是怎麼預bai測的,這邊可以du直接用工具進行**,zhi我用的是tmhmm,網頁連結">網頁連結網頁連結,這兩dao個都是
專,屬直接輸入序列就可以得到結果,結果如下圖所示:
一般圖上會有三個引數,一個是胞內,一個是胞外,一個是跨膜區,這三個值用三條不同顏色的線表示,縱軸的的大小表示的是可能性。圖中tran**embrane值越大,是跨膜區的可能性越大。比如我這個結果,就可能含有六個跨膜區。
最後提一下,最上方那條很粗的粉色的線,上面生紅色的矩形方框就表示跨膜區。
舉例說明蛋白質結構與功能的關係
蛋白質的基本結構是氨基酸,多種氨基酸按不同順序連線在一起並且利用各種作用力形成複雜的結構的多肽鏈就成為了蛋白質。蛋白質，是組成身體的重要營養成分，從頭到腳都是有蛋白質和七大營養 蛋白質的功能是與其結構息息相關的。以血紅蛋白為例。每一血紅蛋白分子由一分子的珠蛋白和四分子亞鐵血紅素組成，珠蛋白約佔96 ...
測定蛋白質含量的方法有哪些，其原理各是什麼
bradford法測定蛋白質濃度 一 實驗原理 雙縮脲法 biuret法 和folin 酚試劑法 lowry法 的明顯缺點和許多限制，促使科學家們去尋找更好的蛋 白質溶液測定的方法。1976年由bradford建立的考馬斯亮蘭法 bradford法 是根據蛋白質與染料相結合的原理設計的。這種蛋白 質...
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用雙縮脲試劑檢測,呈現紫色就有蛋白質 雙縮脲試劑是由雙縮脲試劑a和雙縮脲試劑b兩種試劑組成.雙縮脲試劑a的成分是氫氧化鈉的質量分數為0.1 g ml的水溶液 雙縮脲試劑b的成分是硫酸銅的質量分數為0.01 g ml的水溶液.雙縮脲試劑可以驗證蛋白質的存在.具體方法是 先將雙縮脲試劑a加入組織樣液,搖...