1樓:解脫
通過生物信bai息手段,分析不同du個體基因組zhi間的結構差異,同時完成daosnp及基因組結構註釋。回 dna突變可答誘發癌症。吸菸過程中所釋放的》60種致癌化學物質可與dna結合並對dna鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進行化學修飾從而產生大的加合物,該加合物改變了dna雙螺旋的結構,如果不被核苷酸剪下修復或其他的途徑進行糾正,那麼dna在複製時就會按照non-watson-crick方式進行復制並阻止rna聚合酶進行轉錄,從而引發癌症。
英國劍橋大學和well***e trust sanger研究所一起,於2023年初,在nature雜誌上發表文章,他們用第二代測序技術(abi solid)對一個小細胞肺癌(**all-cell lung cancer, sclc)細胞系nci-h209基因組進行測序,以**煙氣中的致癌物質引發了該細胞系基因組中哪些特定鹼基及其周圍序列的突變及細胞損傷修復路徑。
全基因組測序的意義是什麼?
2樓:太陽_愛向日葵
全基因組測序的意義是使人類從根本上認知疾病發生的原因,做到正確的**疾病、儘早的預防疾病。
定義:全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。
發展歷程:2023年, renato dulbecco是最早提出人類基因組定序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對於癌症的研究將會很有幫助。
美國能源部(doe)與美國國家衛生研究院(nih),分別在2023年與2023年加入人類基因組計劃。除了美國之外,日本在2023年就已經開始研究相關問題,但是並沒有美國那樣積極。到了2023年,詹姆士·華生(dna雙螺旋結構發現者之一)成為nih的基因組部門主管。
2023年開始國際合作。2023年,多個國家召開百慕達會議,以2023年完成定序為目標,分配了各國負責的工作,並且宣佈研究結果將會及時公佈,並完全免費。
簡介:每個人從受精卵開始就繼承了父母的dna遺傳資訊,並且攜帶一生,不易改變。全基因組測序就是通過運用新一代高通量dna測序儀,進行10-20倍覆蓋率的個人全基因組測序,然後與人類基因組精確圖譜比較,得到完整的個人全基因組序列,破譯個人全部的遺傳資訊的過程。
全基因組測序覆蓋面廣,能檢測個體基因組中的全部遺傳資訊;準確性高,其準確率可高達99.99%。
全基因組測序揭示了人類生、老、病、死的奧祕,使人類從根本上認知疾病發生的原因,做到正確的**疾病、儘早的預防疾病。
技術:提取基因組dna,然後隨機打斷,電泳**所需長度的dn**段(0.2~5kb),加上接頭,進行基因簇cluster製備或電子擴增e-pcr,最後利用paired-end(solexa)或者mate-pair(solid)的方法對插入片段進行測序。
然後對測得的序列組裝成contig,通過paired-end的距離可進一步組裝成scaffold,進而可組裝成染色體等。組裝效果與測序深度與覆蓋度、測序質量等有關。目前常用的組裝有:
soapdenovo、trimity、abyss等。
基因測序的應用領域
3樓:北條°伒u闕
英國倫敦
大學學院和美國羅格斯大學的聯合研究團隊,將基因測序技術和超級版計算機技術相結合權,試圖探索解決這一命題。研究人員把艾滋病(hiv)蛋白酶分子作為物件,酶在不同人體中形狀略有不同,尤其是在蛋白質活動區,在那裡酶完成切片並構成了下一個病毒,進而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形狀,就可以找到相應的藥物來阻止這一過程。
研究人員通過模擬人體中不同形狀的艾滋病病毒感染的關鍵蛋白質,演示了由計算機優化給出的多種艾滋病**藥物療效的排序清單。英國倫敦大學學院的皮特.柯文尼教授稱:
「有可能通過病人的基因組序列,推斷出酶的形狀,構建準確的蛋白質三維結構,篩選匹配藥物,並將結果告訴主治醫生給出最優處方。」目前,研究團隊已採用這一思路,對市場上在用的9種艾滋病**藥物中的7種進行了排序驗證。
科學家表示實際工作遠比看起來複雜。目前他們建立的50多個模擬模型,就要配有5000個處理器的計算機不停的計算12-18個小時,還要對計算結果做大量的資料分析,才能給出藥物的排序。今天的通用計算機技術很難勝任這樣的工作,樂觀的看,依當前計算機技術發展速度看,也許十年後真能實現計算機為病人「抓藥」。
什麼情況下需要全基因組測序
4樓:匿名使用者
先說點廢話,新聞說全基因組測序非常高大上,檢測公司說他們的技術非常先進。但別說你了,你的醫生也不知道這玩意兒到底能有啥用。測序技術已經很發達,現在的難題不是技術本身,而是如何將這項技術應用到臨床。
美國nih幾年前開展了一項臨床試驗(clinseq),目的就是**將全基因組測序應用於臨床的模式。我有幸作為遺傳諮詢師參與其中一段時間。我們招募健康成年人,向他們提供全基因組測序前後的遺傳諮詢,看他們對測序結果的理解程度如何,以及追蹤測序結果對他們心理,生活方式和醫療選擇的影響。
下面介紹的內容都來自於我跟受試者的遺傳諮詢,除了紫薇的部分。。
全基因組測序測神馬?
我現在覺得皇阿瑪說紫薇是一本深不可測的書是非常有道理的。紫薇如果是本英文書,裡面的一個章節就是一條染色體,每個章節裡面的段落就是基因,每個段落裡的英文字母就是遺傳密碼。為了讀懂紫薇這個人,皇阿瑪其實可以找機器把這些字母都掃描一遍。
你就發現紫薇這本書長這樣:
植物基因組測序的用途?
5樓:匿名使用者
基因測序主要用於基因工程,通過基因測序我們可以知道植物體中控制某種蛋白質合成的dn**段的鹼基序列,知道了鹼基序列就可以人工合成並大量擴增,根據需要應用於基因工程。
也可以用蛋白質工程的技術對其進行改造,製造出功能更完美,更能滿足人類需要的蛋白質。
6樓:美吉生物
通過對植物基因
組進行de novo測序,可以獲得該物種的基因組序列圖譜,可以從基因組水平上對物種的生長、發育、進化、起源等重大問題進行研究,加深我們對物種的認識,在新基因的發現、物種改良等方面發揮巨大作用;
在已知植物基因組的情況下,對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序,可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法,可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點(snp),插入缺失位點(indel,insertion deletion),結構變異位點(sv,structure variation),拷貝數變異(copy number variation,**v)等變異資訊,從而獲得生物群體的遺傳特徵。這對在群體水平上研究物種的進化歷史、環境適應性、自然選擇等方面具有重大意義。
利用全基因組重測序有助於快速發現與植物重要性狀相關的遺傳變異,縮短分子育種的實驗週期等。
全基因組測序的內容
7樓:一騎寍剨漨ti剮
2023年,克萊格·凡特的塞雷拉基因組公司成立,而且宣佈將在2023年完成定序工作。隨後國際團隊也將完成工作的期限提前。2023年6月26日,塞雷拉公司的代表凡特,以及國際合作團隊的代表弗朗西斯·柯林斯(francis collins),在美國**柯林頓的陪同下發表演說,宣佈人類基因組的概要已經完成。
2023年2月,國際團隊與塞雷拉公司,分別將研究成果發表於《自然》與《科學》兩份期刊。在基因組計劃的研究過程中,塞雷拉基因組使用的是霰彈槍定序法(shotgun sequencing),這種方法較為迅速 ,但是仍需以傳統定序來分析細節。全基因組測序技術主要包括第二代測序技術(ngs)和第三代測序技術。
第二代測序技術已經能夠快速、低成本的進行全基因組測序,其裝置**商主要是solexa (現被illumina公司合併),454(羅氏公司)和solid(ab公司)。第三代測序技術於2023年4月正式推廣,其單分子實時(**rt)測序技術完全不同與第二代測序,它的序列讀長高達3000 bp(pacific biosciences 公司研發)。
全基因組測序,有必要做嗎
8樓:匿名使用者
人類基因組大小3g, 重測序一般需要測定至少20x以上的資料(資料乘數高的話對於資訊分析是有利的),也就是說一般需要測定60g的資料,如果1g按照5000元算的話,需要30萬元。
全基因組重測序是對已知基因組序列的物種進行不同個體的基因組測序,並在此基礎上對個體或群體進行差異性分析。基於全基因組重測序技術,人們可以快速進行資源普查篩選,尋找到大量遺傳變異,實現遺傳進化分析及重要性狀候選基因的**。隨著測序成本降低和擁有參考基因組序列物種增多,全基因組重測序成為動植物育種和群體進化研究迅速有效的方法。
9樓:杜麗姿僑學
這個可從佳學基因的不同專案的描術中找到答案。佳學基因的鉑金至尊因解碼採用全基因組測序,而腫瘤風險評估最初的版本是採用snp晶片法。按照佳學基因解的描述。
全基因組測序,測的是全部序列,可以發現別人沒有、您個人獨有的基因序列變化。而晶片只能檢測已知的變化,而且只能是有限的基因序列。盡客snp晶片法檢測成本低,便獲得的資訊的完整性同全基因組測序相比差很遠。
如果您要做罕見疾病的**查詢或者是腫瘤發病原因的查詢,應當選擇佳學基因基於全基因組測序的鉑金至尊基因解碼基因檢測。
簡化基因組測序和全基因組測序的區別
10樓:匿名使用者
這個可從佳學基因的不同專案的描術中找到答案。佳學基因的鉑金至尊因解碼採用全基因組測序,而腫瘤風險評估最初的版本是採用snp晶片法。按照佳學基因解的描述。
全基因組測序,測的是全部序列,可以發現別人沒有、您個人獨有的基因序列變化。而晶片只能檢測已知的變化,而且只能是有限的基因序列。盡客snp晶片法檢測成本低,便獲得的資訊的完整性同全基因組測序相比差很遠。
如果您要做罕見疾病的**查詢或者是腫瘤發病原因的查詢,應當選擇佳學基因基於全基因組測序的鉑金至尊基因解碼基因檢測。
什麼叫低覆蓋度基因組測序,高通量基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋
不是覆蓋整個基因組的所有序列,而是覆蓋一部分,覆蓋率比較低,就叫低覆蓋度基因組測序 基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋度 測序深度是指bai測序資料對基因組du覆蓋深zhi度,如人類基因組有dao3g,我們測了過濾回得到clean data 90g資料量,那麼答測序深度是90 3 30x,覆蓋度是,...
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